Die Labore dienen der Erprobung neuer Ausstattung im Rahmen des gesetzlichen Auftrags nach §4 ZSKG und dienen zur Beantwortung technisch-wissenschaftlicher Fragestellungen, etwa bei der Entwicklung und Beschaffung neuer Fahrzeuge, Mess- und Schutzausstattung oder von Konzepten zur ergänzenden Ausstattung des Katastrophenschutzes der Länder durch den Bund.

Weiterhin wurde im Rahmen eines Forschungsvorhabens des BBK ein nationales Labornetzwerk zur Diagnostik bioterroristischer Agenzien (NaLaDiBA) eingerichtet.